Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms