Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp988F6VKC7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp988F6VKC7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms