Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtproE9Q612 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms