Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms