Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms