Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdr1E9Q0B4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms