Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms