Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd1E9PZ26 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms