Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms