Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5415E9PXF3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms