Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931408C20RikE9PWP9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms