Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms