Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3298E9PW80 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3298E9PW80 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms