Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms