Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms