Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8994E9PV04 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms