Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga1E1U8D0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga1E1U8D0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga1E1U8D0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga1E1U8D0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga1E1U8D0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga1E1U8D0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga1E1U8D0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga1E1U8D0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga1E1U8D0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga1E1U8D0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga1E1U8D0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga1E1U8D0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga1E1U8D0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Soga1E1U8D0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Soga1E1U8D0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Soga1E1U8D0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms