Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms