Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms