Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa28D3Z1V9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms