Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms