Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 257.8 ms