Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm4950D3YUM8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm4950D3YUM8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm4950D3YUM8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4950D3YUM8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms