Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpna7C0LLJ0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms