Protein–RNA interactions for Protein: B9EJV3

Greb1l, GREB1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1lB9EJV3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Greb1lB9EJV3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Greb1lB9EJV3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms