Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms