Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm20547B8JJN0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm20547B8JJN0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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