Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms