Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cspp1B2RX88 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms