Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AU015836B2RUM3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms