Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms