Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms