Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms