Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AU022751B1B0V2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms