Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf25B1AWN9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms