Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Col4a6B1AVK5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Col4a6B1AVK5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Col4a6B1AVK5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Col4a6B1AVK5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Col4a6B1AVK5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a6B1AVK5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms