Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms