Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms