Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grik3B1AS29 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms