Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms