Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms