Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms