Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ism1A2ATD1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ism1A2ATD1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ism1A2ATD1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ism1A2ATD1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ism1A2ATD1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ism1A2ATD1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ism1A2ATD1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ism1A2ATD1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ism1A2ATD1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms