Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms