Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm12A2AJ77 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms