Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms