Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms