Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

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Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ttc39aA2ACP1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ttc39aA2ACP1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39aA2ACP1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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