Protein–RNA interactions for Protein: A2A9C3

Szt2, KICSTOR complex protein SZT2, mousemouse

Predictions only

Length 3,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szt2A2A9C3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Szt2A2A9C3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Szt2A2A9C3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Szt2A2A9C3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Szt2A2A9C3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms