Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms